Nghiên cứu cầu trúc tâm hoạt động enzyme polysaccharide monooxygenase bằng tính toán lượng tử
Năm xuất bản
2019
Tác giả
Lê, Ngọc Chính
Vũ, Bảo Khánh
Nhan đề tạp chí
ISSN
Nhan đề tập
Nhà xuất bản
Đại học Nguyễn Tất Thành (Viên kỹ thuật công nghệ cao)
Tóm tắt
Nghiên cứu này sử dụng công cụ tính toán lượng tử nhằm mục đích thực hiện tính toán tối ưu hóa cấu trúc không gian và cấu trúc electron của tâm hoạt động protein CelS2 và MtPMO3* dưới các dạng tự nhiên và đột biến. CelS2 và MtPMO3* là các enzyme thuộc họ enzyme polysaccharide monooxygenase, họ enzyme này có khả năng làm tăng mạnh hoạt tính thủy phân cellulose và do đó có đóng vai trò rất lớn trong công nghiệp sản xuất nhiên liệu sinh học. Qua tính toán, chúng tôi thu được thành công các cấu trúc tối ưu hóa ở dạng đột biến và dạng tự nhiên của cả hai enzyme kể trên và đưa ra các kết luận sau: Thứ nhất, cấu trúc dạng tự nhiên của CelS2 có khả năng nhận thêm một phân tử nước để tạo thành dạng phối trí lưỡng chóp tam giác; các cấu trúc ở dạng đột biến gợi ý rằng số phối trí tối đa mà CelS2 có thể nhận được chỉ là 5. Thứ hai, cấu trúc dạng tự nhiên và đột biến cho thấy sự quan trọng của phối tử Q166 trong việc ổn định cấu trúc của mạng lưới liên kết hidro của tâm hoạt động MtPMO3*. Thứ ba, kết quả tính toán cấu trúc CelS2 đưa ra giả thuyết mối tương quan giữa cấu trúc và bức tranh tiến hóa của PMO, giả thuyết mới cần được làm rõ thêm trong các nghiên cứu kế tiếp.
Mô tả
24 tr.
Từ khóa chủ đề
Protein MtPMO3* , Enzyme polysaccharide monooxygenase , Toán lượng tử